"Gece Müdürü" filmi, Arap Baharı sırasında Kahire'de bir otelde gece müdürü olarak çalışan eski İngiliz askeri Jonathan Pine'ın hikayesini anlatır. Gizemli bir kadından aldığı çok gizli belgelerle kendini tehlikeli bir durumun içinde bulan Pine, bu belgelerin dünyanın en acımasız silah kaçakçılarından Richard Roper ile bağlantılı olduğunu keşfeder. Olaylar trajik bir şekilde sonuçlandığında, Pine Roper'dan intikam almak için İngiliz istihbaratıyla iş birliği yapmaya karar verir. Görevi, Roper'ın suç imparatorluğuna sızmak, onun güvenini kazanmak ve içeriden çökertmektir. Bu tehlikeli operasyon sırasında Pine, kendi ahlaki sınırlarını zorlarken, Roper'ın sevgilisi Jed ile de tehlikeli bir yakınlaşma yaşar.